More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1472 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  100 
 
 		 394 aa  789    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  84.53 
 
 		 379 aa  628  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  77.37 
 
 		 376 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  75.6 
 
 		 373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  73.19 
 
 		 370 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  73.94 
 
 		 372 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  73.94 
 
 		 372 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  59.95 
 
 		 415 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  59.47 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  59.37 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  57.41 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  57.26 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  56.99 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  56.58 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  56.61 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  56.65 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  57.41 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  56.69 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  55.8 
 
 		 361 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  56.07 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  57.55 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  57.94 
 
 		 388 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  60.63 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  55.64 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  52.19 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  52.75 
 
 		 364 aa  355  6.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  56.96 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  53.18 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  50.42 
 
 		 348 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  45.12 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  60.87 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  60.87 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  64.19 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  45.53 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  43.13 
 
 		 354 aa  308  9e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  47.85 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  47.09 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.62 
 
 		 362 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.04 
 
 		 363 aa  299  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.62 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.03 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  44.24 
 
 		 357 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  44.54 
 
 		 362 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  52.73 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.09 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  56.91 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  51.27 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  47.56 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  58.7 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  57.72 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  58.27 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  44.14 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  53.09 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  52.99 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  46.55 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  45.53 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  45.53 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  53.67 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  53.67 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  53.67 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  48.2 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  53.2 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  54.33 
 
 		 369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.91 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  47.92 
 
 		 353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  53.41 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  54.94 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.46 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  55.2 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  45.53 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.46 
 
 		 363 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  54.33 
 
 		 369 aa  285  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  55.69 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  57.32 
 
 		 362 aa  285  8e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.16 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  54.37 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  44.57 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  47.92 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  46.27 
 
 		 395 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  43.21 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.87 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.87 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.87 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  50.96 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  43.63 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  54.07 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1898  MRP family ATP-binding protein  51.76 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  56.77 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  58.44 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002982  Mrp protein  52.63 
 
 		 358 aa  279  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.435734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02001  hypothetical protein  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.758943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2248  putative ATPase  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.958524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1534  putative ATPase  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  52.61 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>