More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1048 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  85.84 
 
 
234 aa  360  9e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.55 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.91 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 
232 aa  92  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.12 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.28 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.66 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.29 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.25 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.25 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.99 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  30.23 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  33.5 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.39 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.29 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.58 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  30.14 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.21 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.21 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  31.63 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  30.19 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.04 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  29.05 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  33.33 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  29.15 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  29.85 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  30.95 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  28.83 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  32.93 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  31.25 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  28.28 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.71 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  28.71 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  28.71 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  28.71 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  28.71 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  28.71 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  28.71 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  31.22 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.66 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37688  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  26.9 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  31.22 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.86 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.08 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  27.27 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.24 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.4 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>