217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4286 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4286  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
210 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
210 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  35.2 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.44 
 
 
223 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.16 
 
 
201 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 
213 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  34.74 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.87 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.94 
 
 
207 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  36 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.18 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  36 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  36 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.11 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  36.21 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  37.28 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.51 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  35.91 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  34.66 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  36.52 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  36.52 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  36.52 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.31 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.03 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.43 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  34.86 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.86 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  34.86 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  34.86 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  34.86 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  34.86 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  34.86 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  34.29 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.43 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.03 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.72 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  32.96 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.74 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.6 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.54 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  34.29 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.15 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.57 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.9 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  33.73 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  33.14 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  33.14 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.15 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.9 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  33.14 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  33.14 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  32.24 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  38.59 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  33.14 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.42 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.53 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.47 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.95 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  33.71 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  31.43 
 
 
192 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  37.5 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.33 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.25 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  31.79 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.87 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.73 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.96 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.21 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.24 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.78 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.88 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  36.07 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  36.96 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.32 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.15 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.32 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  27.22 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.37 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.76 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.76 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.76 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.76 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  34.76 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>