32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4460 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  894    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  59.17 
 
 		 1176 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.5 
 
 		 1357 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  60 
 
 		 723 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  57.5 
 
 		 682 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  50.41 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  56.67 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  53.33 
 
 		 542 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  51.22 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  51.24 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  55 
 
 		 632 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50.85 
 
 		 734 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.28 
 
 		 673 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  40.17 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.52 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.38 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  38.98 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  38.79 
 
 		 1115 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  34.29 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0894  parallel beta-helix repeat protein  26.57 
 
 		 755 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0745  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.66 
 
 		 545 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  hitchhiker  0.00012998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1000  Parallel beta-helix repeat protein  24.49 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349147  hitchhiker  0.00938388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  35.25 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  34.43 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  34.43 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  34.43 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0186  hypothetical protein  28.57 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.07 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1925  hypothetical protein  24.13 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6551  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.6 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1010 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6550  hypothetical protein  45.61 
 
 		 277 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.236585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>