75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2963 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2963  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 193 aa  362  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.75 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.72 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.93 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  34.38 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  33.33 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.66 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  33.33 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.84 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.34 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.34 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.04 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.14 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.42 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.08 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  38.33 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  39.13 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.66 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  36.52 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  30 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.48 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.79 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  38.95 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.72 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  38.95 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  37.72 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  38.95 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.48 
 
 		 173 aa  52.4  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  28 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.9 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.35 
 
 		 159 aa  51.2  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15960  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  31.78 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.91 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.87 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  33.7 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  33.7 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  32.43 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  37 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  33.99 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  27.78 
 
 		 172 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.7 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  28 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  30.28 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  31.31 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.04 
 
 		 158 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.91 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  26.54 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.45 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.36 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 156 aa  44.7  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  27.85 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  32.98 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.56 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  28.08 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.26 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.29 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.87 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  38.46 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0700  inner membrane protein FxsA  27.27 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  28 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.67 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.21 
 
 		 200 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  28.57 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.68 
 
 		 130 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.36 
 
 		 129 aa  42  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.14 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  31.3 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.11 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  28.12 
 
 		 129 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.48 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>