128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2675 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 159 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  87.42 
 
 		 158 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  87.42 
 
 		 158 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.51 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.6 
 
 		 192 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.65 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.72 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  46.32 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  37.65 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  32.92 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.58 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  34.27 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.24 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  36.54 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  34.76 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  34.76 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.26 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  39.52 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.09 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.71 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  36.13 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.58 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  32.26 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.4 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.86 
 
 		 202 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.86 
 
 		 202 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.86 
 
 		 202 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.13 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.74 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.56 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  33.8 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.81 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  33.57 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.88 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.68 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.9 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  41 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.62 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.43 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.08 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.25 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.41 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.49 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.17 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  36.59 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  33.33 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  38.41 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  32.81 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.67 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  29.07 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  29.07 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.06 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.17 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.45 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  36.36 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.6 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.48 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.56 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  34.81 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  32.41 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  31.43 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  32.71 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  32.71 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  32.71 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.3 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  32.71 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.86 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.52 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  32.71 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  33.64 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.31 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  38.18 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  38.18 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  38.18 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  38.18 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  38.18 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  30 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  32.41 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  32.41 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  33.64 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.1 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.55 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  29.25 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  36.36 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  35.92 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.14 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.14 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.14 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.14 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.58 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.82 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  30.84 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  26.32 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  27.27 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.93 
 
 		 130 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  33.33 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.76 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.67 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.88 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.26 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>