47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0700 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0700  inner membrane protein FxsA  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0672  FxsA cytoplasmic membrane protein  93.33 
 
 		 210 aa  350  8e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1432  FxsA cytoplasmic membrane protein  75.71 
 
 		 202 aa  255  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.59 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.6 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.22 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.6 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.77 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.26 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.26 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  32.88 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.25 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  34.48 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  34.48 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  27.03 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.49 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.63 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.54 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  25 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.48 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.93 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.25 
 
 		 158 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0030  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.33 
 
 		 142 aa  48.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  39.45 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  26.19 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  39.45 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  39.45 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.45 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  39.45 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  39.45 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  39.45 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.86 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4609  FxsA  39.45 
 
 		 158 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432194  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  36.45 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  36.45 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  36.45 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  36.45 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  36.45 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  24.26 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.35 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.15 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  21.58 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.37 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.24 
 
 		 154 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  22.35 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  23.16 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  23.67 
 
 		 161 aa  42  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>