39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0828 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  55.79 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  53.61 
 
 
214 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  48.5 
 
 
242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  50.29 
 
 
267 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  50.29 
 
 
267 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  50.29 
 
 
267 aa  175  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  36.84 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  47.54 
 
 
231 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  40.76 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  47.85 
 
 
247 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  42.11 
 
 
242 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  47.85 
 
 
252 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  43.81 
 
 
196 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  43.9 
 
 
503 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  36.79 
 
 
208 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  43.9 
 
 
503 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  45.98 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  46.2 
 
 
286 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  46.2 
 
 
286 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  46.2 
 
 
286 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  46.2 
 
 
286 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  46.2 
 
 
286 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  46.2 
 
 
283 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  45.61 
 
 
286 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  38.42 
 
 
301 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  38.02 
 
 
465 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.41 
 
 
667 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  30.59 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  31.46 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  30.34 
 
 
671 aa  46.2  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  25.93 
 
 
646 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  29.66 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  31.46 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  24.26 
 
 
166 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2367  hypothetical protein  26.9 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  32.94 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  30.95 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  26.21 
 
 
254 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>