37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5136 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  292  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  57.39 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0787  DoxX family protein  50.98 
 
 
148 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.639865  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  44.96 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  54.21 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0844  DoxX family protein  49.67 
 
 
174 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.450101  normal  0.144011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4341  hypothetical protein  44.53 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440484  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  45.16 
 
 
174 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  42.47 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  46.84 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  43.69 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  46.91 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  39.81 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  37.66 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  36.13 
 
 
168 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  41.86 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  40.79 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  37.5 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  40.86 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  38.24 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  31.33 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  36.78 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  36.17 
 
 
117 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  48 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  38.71 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  34.52 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  35.21 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  35.71 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  31.37 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  32.43 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  32.43 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  39.51 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  39.51 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  41.03 
 
 
137 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.901088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>