77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0581 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  100 
 
 		 74 aa  147  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  87.84 
 
 		 74 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  66.1 
 
 		 68 aa  84  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  83.6  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  65 
 
 		 63 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  65 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  63.33 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  58.06 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  49.21 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.68 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  43.28 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  43.28 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  43.28 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  50 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.44 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  43.86 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.28 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46.77 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  45.31 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.67 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  43.1 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  38.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  40.3 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  39.62 
 
 		 460 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  43.1 
 
 		 261 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45 
 
 		 273 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  43.86 
 
 		 448 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  42.59 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 454 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  40.38 
 
 		 451 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  42.37 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.1 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  41.51 
 
 		 455 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  31.03 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.04 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.76 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  36.67 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  35.85 
 
 		 461 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  35.85 
 
 		 461 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  32.73 
 
 		 457 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  37.93 
 
 		 407 aa  44.3  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  36.21 
 
 		 458 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  36.73 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  37.29 
 
 		 464 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  35.42 
 
 		 468 aa  43.5  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 454 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 460 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.92 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  35.29 
 
 		 460 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 454 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  38.89 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  31.25 
 
 		 456 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  37.7 
 
 		 471 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  31.91 
 
 		 453 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  31.91 
 
 		 453 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  31.03 
 
 		 454 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  38.18 
 
 		 465 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1190  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.07 
 
 		 267 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.21 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.96 
 
 		 485 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1117  translation initiation factor aIF-2, beta subunit  38.89 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000692895  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  38.3 
 
 		 451 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  40.3 
 
 		 562 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  27.78 
 
 		 202 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0434  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  55.56 
 
 		 269 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.345582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>