54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0722 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  100 
 
 		 234 aa  483  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1062  oxalate decarboxylase OxdD  56.46 
 
 		 398 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4237  oxalate decarboxylase OxdD  55.98 
 
 		 398 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000976291  hitchhiker  0.0000000132545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  58.94 
 
 		 408 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  57.69 
 
 		 404 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  58.17 
 
 		 404 aa  247  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  50.73 
 
 		 405 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  49.04 
 
 		 418 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  48.56 
 
 		 418 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  48.56 
 
 		 418 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  48.56 
 
 		 418 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  48.08 
 
 		 418 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0110  bicupin, oxalate decarboxylase family  48.31 
 
 		 402 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  47.12 
 
 		 418 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  48.08 
 
 		 418 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  47.12 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  47.12 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  47.12 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  47.12 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  47.12 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  47.12 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  47.12 
 
 		 418 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0200  oxalate decarboxylase  44.5 
 
 		 378 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  44.5 
 
 		 658 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  43.72 
 
 		 477 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  40.98 
 
 		 384 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2678  bicupin, oxalate decarboxylase family  42.71 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03563  conserved hypothetical protein  41.63 
 
 		 407 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.86517  normal  0.801175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  35.79 
 
 		 389 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  34.39 
 
 		 389 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  26.63 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2283  Cupin domain protein  27.94 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000254412  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4437  cupin domain-containing protein  29.9 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  35.23 
 
 		 150 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 138 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  34.62 
 
 		 119 aa  45.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.27 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 103 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  33.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1792  hypothetical protein  22.54 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  29.89 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1577  hypothetical protein  22.54 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000455455  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 		 115 aa  42.4  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  35.21 
 
 		 447 aa  42  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1742  hypothetical protein  22.54 
 
 		 211 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.614023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1616  hypothetical protein  22.54 
 
 		 211 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.751864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1873  hypothetical protein  22.92 
 
 		 211 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 114 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 155 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1568  hypothetical protein  22.54 
 
 		 211 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>