72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0235 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  738    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4736  hypothetical protein  29.89 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378543  normal  0.971977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  27.2 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.89 
 
 		 653 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.06 
 
 		 697 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  31.13 
 
 		 702 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  29.93 
 
 		 704 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.69 
 
 		 679 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  28.89 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.08 
 
 		 673 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.08 
 
 		 673 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.08 
 
 		 673 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  28.93 
 
 		 682 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  26.88 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  25.74 
 
 		 633 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  25.74 
 
 		 633 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.26 
 
 		 688 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.6 
 
 		 697 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  28.17 
 
 		 625 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  23.53 
 
 		 698 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  27.33 
 
 		 724 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  26.71 
 
 		 676 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.94 
 
 		 679 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  27.78 
 
 		 690 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  27.4 
 
 		 676 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.9 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  26.12 
 
 		 679 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  25.32 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  26.95 
 
 		 724 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  27.4 
 
 		 676 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  28.68 
 
 		 679 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  27.92 
 
 		 664 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  29.73 
 
 		 699 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  25.6 
 
 		 727 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  27.01 
 
 		 711 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  27.04 
 
 		 700 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  27.01 
 
 		 690 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.01 
 
 		 690 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  27.01 
 
 		 690 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  27.92 
 
 		 664 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  23.08 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.28 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.81 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  26.06 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.67 
 
 		 653 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4098  efflux transporter  26.72 
 
 		 693 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.06 
 
 		 655 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.06 
 
 		 655 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.06 
 
 		 655 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.06 
 
 		 655 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  25.49 
 
 		 691 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  24.46 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  21.71 
 
 		 670 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  25.32 
 
 		 681 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  27.39 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  25.17 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.49 
 
 		 741 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0110  fusaric acid resistance protein, putative  23.84 
 
 		 749 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  25.17 
 
 		 679 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  23.3 
 
 		 713 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.53 
 
 		 678 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.74 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  30.53 
 
 		 679 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  28.68 
 
 		 750 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  27.06 
 
 		 655 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.75 
 
 		 680 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.65 
 
 		 700 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.6 
 
 		 655 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  23.81 
 
 		 700 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  28.35 
 
 		 661 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  26.09 
 
 		 691 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  30.53 
 
 		 699 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>