More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0882 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0882  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  100 
 
 		 640 aa  1319    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.6443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0053  molybdopterin oxidoreductase  35.2 
 
 		 658 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  32.96 
 
 		 746 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.29 
 
 		 727 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  32.67 
 
 		 746 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  34 
 
 		 1176 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  34.3 
 
 		 1173 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 		 757 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  32.86 
 
 		 743 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  33.81 
 
 		 1171 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.21 
 
 		 729 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  32.13 
 
 		 724 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  32.72 
 
 		 743 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.2 
 
 		 734 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  33.77 
 
 		 716 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  33.04 
 
 		 1188 aa  359  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 744 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  32.56 
 
 		 1180 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.99 
 
 		 917 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  30.34 
 
 		 1228 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 		 1232 aa  340  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  31.81 
 
 		 908 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  32.24 
 
 		 906 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  31.25 
 
 		 1395 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  31.25 
 
 		 1395 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.36 
 
 		 1395 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  31.21 
 
 		 762 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  32.42 
 
 		 894 aa  332  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 		 1403 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  31.15 
 
 		 1397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  31.23 
 
 		 958 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  31.15 
 
 		 1397 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.43 
 
 		 677 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 		 1409 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  31.07 
 
 		 907 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  31.15 
 
 		 1395 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.53 
 
 		 716 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  31.06 
 
 		 734 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.01 
 
 		 1401 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  31.04 
 
 		 1405 aa  324  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  31.57 
 
 		 901 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.83 
 
 		 716 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  31.07 
 
 		 880 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  31.74 
 
 		 904 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 		 1405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  31.36 
 
 		 1312 aa  321  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 		 1394 aa  320  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  30.87 
 
 		 1418 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.15 
 
 		 1383 aa  319  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 		 1396 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.73 
 
 		 1418 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.73 
 
 		 1418 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.73 
 
 		 1418 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  30.29 
 
 		 1384 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  30.73 
 
 		 1398 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  31.45 
 
 		 908 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  30.73 
 
 		 1418 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.73 
 
 		 1418 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.67 
 
 		 951 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.67 
 
 		 951 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  30.7 
 
 		 727 aa  317  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  30.83 
 
 		 946 aa  316  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.67 
 
 		 951 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.67 
 
 		 951 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  30.67 
 
 		 951 aa  316  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  30.86 
 
 		 745 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.69 
 
 		 688 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.53 
 
 		 951 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  30.12 
 
 		 873 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  31.01 
 
 		 906 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  30.67 
 
 		 951 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  31.29 
 
 		 1407 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  30.49 
 
 		 1313 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.09 
 
 		 716 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.66 
 
 		 716 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  30.78 
 
 		 931 aa  312  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 		 734 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  30.69 
 
 		 895 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.4 
 
 		 899 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.06 
 
 		 723 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  31.45 
 
 		 882 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.72 
 
 		 920 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  30.15 
 
 		 929 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  29.62 
 
 		 874 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 		 967 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  31.16 
 
 		 955 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  31.02 
 
 		 885 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.7 
 
 		 674 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.15 
 
 		 674 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  30.54 
 
 		 905 aa  310  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  31.02 
 
 		 899 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.38 
 
 		 898 aa  309  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.92 
 
 		 879 aa  309  8e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  28.87 
 
 		 715 aa  309  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  28.87 
 
 		 715 aa  309  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.11 
 
 		 951 aa  309  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.8 
 
 		 933 aa  309  9e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  28.87 
 
 		 715 aa  309  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.87 
 
 		 715 aa  309  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>