More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1777 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  100 
 
 		 277 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  81.23 
 
 		 275 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  46.08 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2964  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3562  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  43.26 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2524  single-strand binding protein  38.14 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000823265  normal  0.0673427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  46.49 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  45.61 
 
 		 183 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  46.55 
 
 		 183 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  47.37 
 
 		 162 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  48.54 
 
 		 172 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0485  single-stranded DNA-binding protein  49.51 
 
 		 181 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0514  single-stranded DNA-binding protein  49.51 
 
 		 181 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0518  single-stranded DNA-binding protein  49.51 
 
 		 181 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.183562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 165 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2969  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 352 aa  95.9  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 236 aa  95.5  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 236 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2840  single-strand binding protein  31.97 
 
 		 238 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  39.84 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.51 
 
 		 149 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  41.74 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.82 
 
 		 157 aa  93.2  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  40.87 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 146 aa  92  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 191 aa  92  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  37.06 
 
 		 164 aa  92  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 164 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  41.79 
 
 		 174 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0658  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 164 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  44.33 
 
 		 164 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 160 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 235 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  40.38 
 
 		 185 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  39.72 
 
 		 137 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  40.38 
 
 		 185 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  40.38 
 
 		 177 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  40.38 
 
 		 177 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 130 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  45 
 
 		 165 aa  89.4  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  37.16 
 
 		 148 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 146 aa  88.6  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  36 
 
 		 130 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  41.35 
 
 		 178 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 157 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 146 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 164 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 157 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 147 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 152 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  35.44 
 
 		 161 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 154 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  37.06 
 
 		 164 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 164 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 155 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 163 aa  86.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 161 aa  86.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  44.74 
 
 		 164 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 156 aa  86.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 156 aa  86.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 188 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  41.74 
 
 		 167 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  44.35 
 
 		 166 aa  85.9  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  41.94 
 
 		 164 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.03 
 
 		 143 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 		 181 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 139 aa  85.5  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  35.81 
 
 		 139 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  30.2 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  43.43 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  41.74 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  41.74 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>