More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2964 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2964  single-strand binding protein  100 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  49.01 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  42.07 
 
 		 277 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  41.52 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2524  single-strand binding protein  34.24 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000823265  normal  0.0673427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2840  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 238 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  42.2 
 
 		 186 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 152 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 167 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 171 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 161 aa  85.5  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2969  single-strand binding protein  31.44 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  45.1 
 
 		 141 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  42.02 
 
 		 166 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3562  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.79 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.2 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  40.21 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36.64 
 
 		 161 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  32.94 
 
 		 175 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  40 
 
 		 159 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  38.38 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  34.75 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  34.71 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  32.95 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 180 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  33.08 
 
 		 152 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  41.6 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  32.47 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.25 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  44.21 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  31.79 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  30.51 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  38.78 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  38.78 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  40.43 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  38.78 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  32.73 
 
 		 164 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  35.25 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 138 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 163 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  27.67 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 168 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  40.18 
 
 		 172 aa  72  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  31.9 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  39.36 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.21 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  27.67 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  41.75 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.21 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.9 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>