234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2840 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2840  single-strand binding protein  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2524  single-strand binding protein  61.02 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000823265  normal  0.0673427 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3562  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  34.82 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  31.97 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2964  single-strand binding protein  36.09 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  30.61 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2969  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  32 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  32.46 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  32.56 
 
 		 163 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  30.97 
 
 		 148 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 161 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 161 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 163 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 161 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  30.58 
 
 		 149 aa  52.8  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 155 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 151 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 150 aa  52  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  33.65 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  30 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0204  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 154 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 152 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  33.65 
 
 		 168 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 159 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  33.65 
 
 		 168 aa  49.7  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  31.68 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 172 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  33.98 
 
 		 139 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  27.2 
 
 		 120 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  31.53 
 
 		 147 aa  48.9  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  28.87 
 
 		 146 aa  48.5  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  32.32 
 
 		 166 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  26.17 
 
 		 166 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 169 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  30.21 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  30.84 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  34.38 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  29.01 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  32.29 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  32.32 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  31.19 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  34.38 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  33.66 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  28.28 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 139 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.25 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  30.39 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>