More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1180 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 144 aa  293  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  88.89 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  66.67 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  182  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  62.41 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  65.19 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 145 aa  180  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  179  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 140 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  65.89 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 144 aa  177  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 140 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 140 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  62.04 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  61.15 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  176  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  176  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  176  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  61.49 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  61.49 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  61.49 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  57.97 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  57.55 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  58.39 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2225  50S ribosomal protein L11  61.49 
 
 		 148 aa  173  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 143 aa  173  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 143 aa  172  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  60.99 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  59.42 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  59.26 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>