31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4600 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  43.38 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  46.53 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  45.05 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  39.15 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  38.33 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  41.07 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  37.92 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  27.73 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  31.14 
 
 		 345 aa  89  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 593 aa  85.5  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  31.78 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  32.34 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  27.98 
 
 		 413 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  29.67 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  25 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  28.38 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_4167  predicted protein  32.06 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.512731 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03914  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  28.07 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349103 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  25.78 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  25 
 
 		 566 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  22.05 
 
 		 637 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  30.19 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1921  hypothetical protein  23.81 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  28.41 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 467 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  25.32 
 
 		 883 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6912  glycoside hydrolase family 16  24.06 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 1321 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>