49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4088 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  55.95 
 
 
289 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  37.31 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  38.56 
 
 
273 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  35.5 
 
 
273 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  34.15 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  39.32 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  33.88 
 
 
282 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  32.05 
 
 
286 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  36.04 
 
 
268 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  34.32 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  34.32 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  34.18 
 
 
270 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  28.33 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  28.51 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  28.51 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  26 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  26.1 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  26.1 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  28.02 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  28.38 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  28.93 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  27.83 
 
 
864 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.82 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  27.75 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  24.51 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  29.86 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.91 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  30.51 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  25.82 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  25.82 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  24.79 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  26.61 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  24.62 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  25.69 
 
 
275 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  24.77 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  25.11 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  26.17 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  26.64 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  25.71 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  27.16 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  26.75 
 
 
259 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  26.75 
 
 
259 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  26.75 
 
 
248 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  26.75 
 
 
248 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  26.75 
 
 
248 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>