More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3783 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
353 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  51.48 
 
 
357 aa  342  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50.57 
 
 
357 aa  339  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  54.49 
 
 
350 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  52.94 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4242  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  55.49 
 
 
356 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.79779  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  54.07 
 
 
350 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  52.35 
 
 
357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  51.49 
 
 
350 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  52.79 
 
 
357 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  52.06 
 
 
357 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.25 
 
 
344 aa  309  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 
346 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.29 
 
 
417 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.25 
 
 
334 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  45.4 
 
 
360 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.93 
 
 
356 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.07 
 
 
352 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  44.31 
 
 
357 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
356 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
357 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.72 
 
 
379 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.12 
 
 
356 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.31 
 
 
347 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 
365 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.38 
 
 
344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.25 
 
 
343 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.86 
 
 
359 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.94 
 
 
353 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 
355 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
343 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.28 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.17 
 
 
351 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
360 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.87 
 
 
351 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.9 
 
 
351 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
348 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.58 
 
 
351 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.81 
 
 
355 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.03 
 
 
345 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.58 
 
 
351 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.65 
 
 
350 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.87 
 
 
351 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.58 
 
 
351 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.58 
 
 
351 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.73 
 
 
345 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.73 
 
 
345 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.61 
 
 
351 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.16 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 
355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  37.97 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.2 
 
 
350 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.59 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
350 aa  232  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  37.21 
 
 
352 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 
335 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
356 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.72 
 
 
345 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.06 
 
 
350 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
352 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.89 
 
 
348 aa  229  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.28 
 
 
414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.3 
 
 
349 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
370 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.05 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.99 
 
 
369 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1504  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.42 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.643881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.18 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 
334 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.94 
 
 
365 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.32 
 
 
383 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.32 
 
 
383 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.71 
 
 
349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.23 
 
 
358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.82 
 
 
354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.89 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
354 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.52 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.14 
 
 
444 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.43 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.73 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.1 
 
 
359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
379 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.69 
 
 
376 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
379 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.53 
 
 
379 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  39.58 
 
 
365 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.4 
 
 
394 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1102  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.67 
 
 
347 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 
383 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.44 
 
 
391 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.85 
 
 
376 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
331 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06844  mitochondrial 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12790)  37.79 
 
 
505 aa  206  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.608816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 
379 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 
379 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 
379 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.79 
 
 
382 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
350 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>