More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0657 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
311 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91 
 
 
311 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.67 
 
 
311 aa  534  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0802699  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.34 
 
 
308 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.62 
 
 
306 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.86 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.42 
 
 
295 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.46 
 
 
297 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903953  hitchhiker  0.00389411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.59 
 
 
296 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0223  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.53 
 
 
295 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7148  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  69.72 
 
 
292 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.46 
 
 
295 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00302437  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.58 
 
 
311 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.270364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.81 
 
 
295 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.71 
 
 
295 aa  381  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.258326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.96 
 
 
296 aa  344  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.16 
 
 
303 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
301 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.69 
 
 
299 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  38.69 
 
 
299 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.69 
 
 
299 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  38.69 
 
 
299 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
299 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  38.69 
 
 
299 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
299 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  40.99 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.45 
 
 
303 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.58 
 
 
303 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.58 
 
 
303 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
301 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.58 
 
 
303 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.58 
 
 
303 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.22 
 
 
303 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
303 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  39.22 
 
 
303 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
303 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.58 
 
 
303 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
308 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  42.69 
 
 
303 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  42.69 
 
 
303 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
300 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  42.69 
 
 
303 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  42.69 
 
 
303 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  42.69 
 
 
303 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
301 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
302 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
302 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
302 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
302 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  40.81 
 
 
302 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  40.81 
 
 
302 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  40.81 
 
 
302 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  40.79 
 
 
297 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
305 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.79 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
297 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
297 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
300 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.81 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  40.81 
 
 
300 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.79 
 
 
301 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
309 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
299 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
298 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  42.15 
 
 
300 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
299 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
300 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
299 aa  192  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
308 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
275 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  35.28 
 
 
301 aa  188  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
300 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  34.69 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  35.84 
 
 
341 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.84 
 
 
308 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
310 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
301 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
280 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
294 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
304 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
300 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7325  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.27 
 
 
300 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
305 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
300 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
309 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0230  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.91 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58450  ABC transporter permease  37.89 
 
 
303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>