47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4581 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  100 
 
 
95 aa  189  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5448  hypothetical protein  52.13 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  44.09 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  43.62 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  36.56 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  34.04 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2734  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0085  phage-like  37.63 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  37.63 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  41.38 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  36.96 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  39.56 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2242  protein of unknown function DUF891  35.87 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  36.56 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1723  protein of unknown function DUF891  31.58 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2041  hypothetical protein  31.11 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  38.89 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  33.71 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  31.46 
 
 
190 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4563  protein of unknown function DUF891  38.96 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000704217  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  33.33 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  31.11 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  31.11 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0745  hypothetical protein  31.18 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  32.22 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  35.23 
 
 
128 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01488  putative phage protein  36.05 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01499  hypothetical protein  36.05 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1441  protein of unknown function DUF891  32.56 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8281  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167308  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  34.69 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3539  protein of unknown function DUF891  36.05 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0281  protein of unknown function DUF891  36.05 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  37.5 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  36.36 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  39.34 
 
 
118 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0806  prophage protein gp49  29.55 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  40.98 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  39.66 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3255  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725337  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  32.99 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  32.81 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  34.18 
 
 
119 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>