81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4484 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  100 
 
 
360 aa  690    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  90.28 
 
 
360 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  89.64 
 
 
361 aa  524  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  70.25 
 
 
358 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  33.24 
 
 
377 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  36.5 
 
 
373 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  32.96 
 
 
371 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  32.56 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  33.15 
 
 
371 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  34.25 
 
 
376 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  32.59 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  32.38 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  32.48 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  36.15 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  32.39 
 
 
368 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  32.76 
 
 
350 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  32.64 
 
 
386 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  28.96 
 
 
391 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  30.16 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  28.92 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  32.65 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  31.73 
 
 
369 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  36.12 
 
 
378 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  34.56 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  32.29 
 
 
369 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  33.24 
 
 
358 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  31.69 
 
 
402 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  34.52 
 
 
416 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  28.57 
 
 
410 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  30.95 
 
 
343 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  28.72 
 
 
408 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  31.08 
 
 
376 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  30.77 
 
 
370 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  34.2 
 
 
358 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  32.69 
 
 
363 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  32.13 
 
 
411 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  29.25 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  28.86 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  33.52 
 
 
478 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  28.53 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  28.57 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  32.96 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  28.57 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  28.57 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  28.57 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  28.57 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
714 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  32.85 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  29.12 
 
 
412 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  30.85 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  28.34 
 
 
412 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  28.34 
 
 
412 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  32.56 
 
 
365 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  30.75 
 
 
336 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  28.42 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  31.78 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  28.04 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  28.65 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0220  hypothetical protein  31.22 
 
 
201 aa  72.8  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152958  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  35.44 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  27.39 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  31.25 
 
 
382 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  26.72 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  31.34 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  31.03 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  29.07 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  30.14 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  29.75 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  28.25 
 
 
354 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  32.69 
 
 
330 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  36.46 
 
 
397 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  26 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  28.8 
 
 
662 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  30.43 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  27.81 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  28.16 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  27.12 
 
 
691 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.75 
 
 
638 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  30.97 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  33.06 
 
 
360 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  33.33 
 
 
399 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>