66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2960 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  100 
 
 		 389 aa  781    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  46.52 
 
 		 391 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  46.11 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  42.01 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  36.67 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  35.31 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  36.88 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  35.11 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  31.3 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  33.98 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  33.84 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  34.76 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  30.05 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  31.22 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  31.28 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 714 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  30.53 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  30.05 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  30.42 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  29.18 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  30.29 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  30.6 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  29.34 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  28.09 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  31.32 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  29.3 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  29.3 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  29.3 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  29.3 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  29.3 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  29.94 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  28.76 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  29.03 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  29.03 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  28.46 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  30.43 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  26.86 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  28.07 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  28.4 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  36.08 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  35.36 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  24.87 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  28.07 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  35.44 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  28.39 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  26.4 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  28.26 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  26.69 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  26.99 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  28.8 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  28.81 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  29.07 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  26.68 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  27.01 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  26.44 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  29.03 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0220  hypothetical protein  32.61 
 
 		 201 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  28.99 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  25.62 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  27.53 
 
 		 691 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  25.49 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  22.34 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  25.11 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  24.76 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>