76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4196 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  100 
 
 
467 aa  952    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  37.57 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  37.57 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  37.57 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  37.57 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  37.57 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  37.85 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  37.29 
 
 
412 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  37.29 
 
 
412 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  34.32 
 
 
478 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  31.53 
 
 
380 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  32.6 
 
 
416 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  32.51 
 
 
401 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  33.61 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  32.6 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  28.41 
 
 
363 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  30.81 
 
 
336 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  29.43 
 
 
367 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  28.22 
 
 
350 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  25.4 
 
 
369 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  26.04 
 
 
369 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  30.73 
 
 
363 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  28.96 
 
 
376 aa  90.1  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  29.41 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  27.7 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  27.27 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  28.85 
 
 
351 aa  87.4  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  31.61 
 
 
358 aa  86.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  28.57 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  27.87 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  29.92 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
714 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  31.66 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  26.23 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  25.54 
 
 
410 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  27.22 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  27.97 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  28.02 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  27.35 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  27.35 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  27.44 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  28.57 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  24.25 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  26.57 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  26.02 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  25.14 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  25.14 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1688  acyltransferase  27.35 
 
 
365 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  24.06 
 
 
343 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  26.09 
 
 
318 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  27.13 
 
 
386 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  24.3 
 
 
321 aa  58.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0320  acyltransferase 3  27.48 
 
 
365 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.48225  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  33.33 
 
 
403 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  34.31 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  35.19 
 
 
367 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  33.33 
 
 
372 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  28.16 
 
 
367 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.18 
 
 
359 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  29.15 
 
 
713 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.9 
 
 
584 aa  49.7  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.93 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.93 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.93 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  24.44 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  31.37 
 
 
403 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  38.6 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  43.21 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  36.49 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.27 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  26.67 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  27.91 
 
 
436 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  24.7 
 
 
742 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  26.43 
 
 
667 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  38.1 
 
 
380 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.78 
 
 
404 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>