56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3763 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3763  acyltransferase 3  100 
 
 
379 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3416  acyltransferase 3  46.63 
 
 
369 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3144  acyltransferase 3  47.19 
 
 
369 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0975929  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0774  acyltransferase 3  39.6 
 
 
367 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  39.74 
 
 
343 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  31.3 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  33.07 
 
 
391 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  32.27 
 
 
391 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  31.65 
 
 
402 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3883  putative O-acetyl transferase  32.81 
 
 
408 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  29.79 
 
 
410 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1763  acyltransferase 3  31.05 
 
 
411 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172026  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
714 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  32.85 
 
 
371 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  32.9 
 
 
371 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  29.36 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  32.33 
 
 
399 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  28.29 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  27.91 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  28.42 
 
 
373 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  28.13 
 
 
368 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0853  acyltransferase 3  30.07 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  29.55 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1470  acyltransferase 3  29.04 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0978783  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  35.8 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4366  acyltransferase 3  30.41 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  27.35 
 
 
416 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  31.36 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  28.49 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  25.64 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  28.57 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  26.59 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  27.14 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3098  putative O-antigen acetylase WbiA  27.37 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3158  O-antigen acetylase WbiA  27.37 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0929  putative O-antigen acetylase  27.37 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1984  O-antigen acetylase, putative  27.37 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3135  putative O-antigen acetylase WbiA  27.37 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.45062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1475  acetyltransferase  27.1 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2759  putative O-antigen acetylase  27.1 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00608495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1846  putative O-antigen acetylase  27.1 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  28.81 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  23.64 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4908  acyltransferase 3  26.79 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0238  acyltransferase 3  27.54 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3779  putative acetyltransferase  25.13 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4196  acyltransferase 3  24.59 
 
 
467 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.248817  normal  0.804639 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5025  acyltransferase 3  27.67 
 
 
372 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767056  normal 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  25.22 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6949  acyltransferase 3  25.14 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08930  predicted acyltransferase  27.57 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  30.6 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  23.97 
 
 
336 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  30.7 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2337  acyltransferase 3  26.48 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.844006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4525  acyltransferase 3  25.32 
 
 
367 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.896938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>