27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0220 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0220  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152958  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0214  acyltransferase 3  55.56 
 
 
318 aa  208  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.855839  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  28.47 
 
 
391 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  25.99 
 
 
391 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0502  acyltransferase 3  30.73 
 
 
358 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0612355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2596  acyltransferase 3  32.28 
 
 
371 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.341456  normal  0.016657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1535  putative O-antigen acetylase  31.5 
 
 
371 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3692  acyltransferase 3  32.88 
 
 
402 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.505724  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  25.27 
 
 
370 aa  51.6  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3914  acyltransferase 3  30.7 
 
 
410 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1799  acyltransferase 3  28.86 
 
 
377 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0478  acyltransferase 3  28.28 
 
 
368 aa  48.5  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.254829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  31.05 
 
 
360 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0211  hypothetical protein  30 
 
 
373 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.41334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2960  sugar acetylase  32.61 
 
 
389 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4372  acyltransferase 3  32.19 
 
 
361 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4003  acyltransferase 3  31.51 
 
 
360 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.602607  normal  0.602748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2004  acyltransferase 3  31.91 
 
 
416 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  27.44 
 
 
363 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3240  acyltransferase 3  30.72 
 
 
378 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000020553  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  28.4 
 
 
376 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2999  acyltransferase 3  27.01 
 
 
343 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05412  putative O-antigen acetylase  27.27 
 
 
350 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.480062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
714 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  30.68 
 
 
321 aa  41.6  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0736  acyltransferase 3  33.66 
 
 
399 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  42 
 
 
675 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>