186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3434 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  100 
 
 		 148 aa  277  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  88.51 
 
 		 148 aa  218  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  75.68 
 
 		 148 aa  214  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  87.68 
 
 		 148 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  71.88 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  51.8 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  51.37 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  50.35 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  52.1 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  49.65 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  49.65 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  54.55 
 
 		 178 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  46.76 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  41.73 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  42.36 
 
 		 172 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  40.3 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  44.19 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  39.86 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  39.84 
 
 		 178 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  39.73 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  39.71 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  41.73 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  39.73 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  40.94 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  41.84 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  40.94 
 
 		 172 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  36.76 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  42.54 
 
 		 184 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  34.07 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  41.73 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  41.73 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  38.3 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  31.97 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  45.19 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  44.85 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  40.3 
 
 		 176 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  37.68 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  40.19 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  30.61 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  35.71 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  42.65 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  37.24 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  36.84 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  45.35 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  38.52 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  41.91 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  45.35 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  32.58 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  32.61 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  38.28 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  31.39 
 
 		 317 aa  72  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  35.51 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  35.51 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.21 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  35.62 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.23 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  32.14 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  30.6 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  33.08 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  36.81 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  31.43 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  31.43 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  33.87 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  32.28 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  31.34 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  30.71 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  30.92 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  31.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  30.97 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  27.48 
 
 		 297 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  35.42 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  35.42 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  36.88 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  29.1 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  29.1 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  31.62 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2771  hypothetical protein  27.66 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  38.64 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  32.06 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  31.06 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  29.71 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  30.77 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  27.2 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  28.06 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  31.11 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  32.91 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  31.43 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  30.3 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3799  hypothetical protein  28.95 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000162069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>