29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2982 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 244 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  77.73 
 
 		 251 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  79.68 
 
 		 273 aa  331  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  53.72 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  47.44 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  45.49 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  35 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  31.77 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  32.65 
 
 		 298 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  33.21 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  31.19 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  31.82 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  29.33 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  28.27 
 
 		 297 aa  88.6  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  38.66 
 
 		 306 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  27.94 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  45.24 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  19.67 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  18.14 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  41.67 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  44.44 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  35.14 
 
 		 383 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  30.65 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  38.71 
 
 		 547 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  36.11 
 
 		 304 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  34.21 
 
 		 1144 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  40 
 
 		 417 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  36.11 
 
 		 368 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>