49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1727 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  63.83 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  53.9 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  41.1 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  45.58 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  47.37 
 
 		 95 aa  97.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  32.32 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  43.48 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  43.48 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  52.31 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  48.48 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  30.08 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  29.38 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  29.6 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  29.14 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  26.67 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  48.33 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  25.95 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  37.11 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  20.31 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  26.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  27.43 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  32.97 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  32.97 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  32.97 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  32.97 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  32.97 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  32.97 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  27.43 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  23.85 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  23.62 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  27.56 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  28.15 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  31.87 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  26.52 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2967  hypothetical protein  30.08 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00967435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  27.42 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  23.81 
 
 		 132 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  26.55 
 
 		 149 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  26.52 
 
 		 127 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  20.13 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  22.56 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  17.97 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>