37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1369 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  91.32 
 
 		 256 aa  407  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  91.32 
 
 		 266 aa  407  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  53.28 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  52.87 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  51.97 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  37.94 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  43.7 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  37.94 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 274 aa  148  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  42.44 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  42.02 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  38.46 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  41.59 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.95 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  51.67 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  36.75 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  36.75 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.54 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  53.12 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  37.25 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  46.88 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  35.9 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  37.25 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.56 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  26.91 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  47.54 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  25.1 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  41.98 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  29.15 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  39.19 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.77 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  40.74 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  64.86 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  34.95 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  47.22 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>