266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1923 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1923  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1699  hypothetical protein  66.12 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  50.53 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2424  hypothetical protein  49.74 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000350737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  53.09 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  48.98 
 
 		 212 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  53.09 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  53.7 
 
 		 152 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  53.7 
 
 		 152 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  53.7 
 
 		 152 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  53.7 
 
 		 152 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2013  hypothetical protein  48.73 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000868215  normal  0.600676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  53.09 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  49.75 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  53.7 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  53.7 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  54.32 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  53.7 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  53.7 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  53.7 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  53.7 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  53.7 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  53.42 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  52.8 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  53.42 
 
 		 152 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  49.24 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  51.18 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3385  hypothetical protein  49.24 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.214146  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2033  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2132  hypothetical protein  45.81 
 
 		 204 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1115  hypothetical protein  50.9 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1208  hypothetical protein  50.3 
 
 		 162 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1287  hypothetical protein  49.7 
 
 		 162 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00293096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2751  hypothetical protein  39.84 
 
 		 295 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891527  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1095  hypothetical protein  43.86 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1229  hypothetical protein  45.03 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0921139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  43.87 
 
 		 161 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  45.33 
 
 		 144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2454  hypothetical protein  44.23 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  38.16 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.52 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  40.13 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  38.75 
 
 		 153 aa  91.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  42.58 
 
 		 151 aa  91.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  38.82 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  41.22 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  38.82 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  41.22 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  39.47 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  38.56 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  41.22 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  41.22 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  39.47 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  39.47 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  40.54 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  40.54 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.53 
 
 		 153 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  40.54 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  37.25 
 
 		 151 aa  87.8  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  38.96 
 
 		 158 aa  87.8  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  39.07 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  33.77 
 
 		 262 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  43.33 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  44.17 
 
 		 145 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  38.82 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  36.21 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  35.8 
 
 		 151 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  42.5 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  42.5 
 
 		 169 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  36.08 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  36.08 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  33.95 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  33.55 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  33.95 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  32.14 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  41.32 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  36.84 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  34.01 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  44.86 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  44.86 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  40.87 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  42.98 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  38.35 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  39.67 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>