35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1165 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1165  proline rich protein  100 
 
 		 230 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0221177  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0678  proline rich protein  58.6 
 
 		 185 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2765  proline rich protein  57.45 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3468  hypothetical protein  41.42 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0852278  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0831  hypothetical protein  43.28 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3265  hypothetical protein  41.7 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2795  hypothetical protein  40.42 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2590  proline rich protein  56.03 
 
 		 186 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3731  proline rich protein  50.33 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.655053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2186  proline rich protein  54.61 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0933  hypothetical protein  37.76 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2377  proline rich protein  50.59 
 
 		 189 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1401  hypothetical protein  43.38 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3713  hypothetical protein  44.7 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1449  hypothetical protein  38.32 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0563  hypothetical protein  75.68 
 
 		 50 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0055  hypothetical protein  29.61 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3617  hypothetical protein  33.81 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4132  hypothetical protein  31.69 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.382734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4102  hypothetical protein  31.69 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0237  hypothetical protein  31.69 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4220  hypothetical protein  30.99 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405924  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1282  hypothetical protein  31.88 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.467166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4817  hypothetical protein  30.37 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2446  hypothetical protein  31.17 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210409  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5494  hypothetical protein  34.92 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4505  hypothetical protein  31.47 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3912  hypothetical protein  29.66 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3716  hypothetical protein  28.99 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.801315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3787  hypothetical protein  29.71 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.803135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0341  hypothetical protein  30.65 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1911  hypothetical protein  39.32 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0053  hypothetical protein  32.31 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4425  hypothetical protein  35.51 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0454  hypothetical protein  32.85 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>