24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0367 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  795    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  80.91 
 
 
419 aa  614  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  71.68 
 
 
416 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  74.28 
 
 
419 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  71.84 
 
 
416 aa  544  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  71.43 
 
 
416 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  76.3 
 
 
425 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  65.54 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  58.1 
 
 
420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  59.67 
 
 
430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  59.18 
 
 
416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  58.89 
 
 
419 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  60.24 
 
 
419 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  59.42 
 
 
416 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  58 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  58.1 
 
 
420 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  54.59 
 
 
420 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  51.45 
 
 
420 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  46.8 
 
 
509 aa  323  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  43.47 
 
 
537 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  49.16 
 
 
447 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  48.92 
 
 
486 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  48.67 
 
 
486 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  28.34 
 
 
450 aa  200  5e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>