85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0250 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1103    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  52.13 
 
 		 543 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  51.57 
 
 		 582 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  50.43 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  45.28 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  41.59 
 
 		 550 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 		 487 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 		 536 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  40.79 
 
 		 540 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  40.79 
 
 		 540 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  39.55 
 
 		 555 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  37.54 
 
 		 556 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  38.36 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  39.45 
 
 		 540 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  39.45 
 
 		 540 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  38.17 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  37.98 
 
 		 539 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  38.18 
 
 		 539 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  38.18 
 
 		 539 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  37.6 
 
 		 539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.13 
 
 		 492 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  30.6 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  38.46 
 
 		 483 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  42.11 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  30.2 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  32.93 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  31.55 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  31.55 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  27.43 
 
 		 532 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  31.55 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  40 
 
 		 498 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  40 
 
 		 498 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  43.42 
 
 		 498 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  41.38 
 
 		 494 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 494 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  41.38 
 
 		 578 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  40.54 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  37.04 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  31.76 
 
 		 723 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 533 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  35.71 
 
 		 488 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  40.79 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  33.1 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  38.6 
 
 		 517 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  32.2 
 
 		 548 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  41.33 
 
 		 493 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  25.93 
 
 		 504 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  34.96 
 
 		 451 aa  47.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  33.03 
 
 		 540 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  35.8 
 
 		 494 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4526  flavin-containing monooxygenase FMO  27.8 
 
 		 526 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  44.59 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3824  putative flavin-binding monooxygenase  47.5 
 
 		 493 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.278459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  44.59 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  31.53 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  48.08 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  45.28 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  43.84 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  41.07 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  40.74 
 
 		 514 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1471  flavin-binding monooxygenase-like protein  32.22 
 
 		 524 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  35.14 
 
 		 452 aa  45.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4269  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 		 512 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0844717  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1270  putative monooxygenase  32.22 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2526  flavin-binding monooxygenase-like protein  32.22 
 
 		 524 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1145  flavin-containing monooxygenase FMO  30.19 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854282  normal  0.14107 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1009  flavin-containing monooxygenase FMO  32.22 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.449884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1347  putative monooxygenase  32.22 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0558  4-hydroxyacetophenone monooxygenase  32.22 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4068  flavin-containing monooxygenase FMO  30.84 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10911  monooxygenase  42.59 
 
 		 509 aa  44.3  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  31.03 
 
 		 344 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 556 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5626  flavin-containing monooxygenase FMO  29.91 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0554215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4674  flavin-containing monooxygenase FMO  29.91 
 
 		 526 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727347  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3694  flavin-containing monooxygenase FMO  29.91 
 
 		 526 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 490 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  30.69 
 
 		 500 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 399 aa  43.9  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  33.71 
 
 		 557 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  27.08 
 
 		 444 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>