More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1677 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  147  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  84.62 
 
 		 69 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  79.69 
 
 		 69 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  68.66 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  74.19 
 
 		 69 aa  97.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 63 aa  94  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 72 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 63 aa  84  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  56.06 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  54.55 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  53.03 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 68 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  59.09 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  51.52 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 65 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  53.85 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  53.12 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  56.92 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  55.56 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  55.56 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  55.56 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  55.56 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  55.56 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  55.56 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  55.56 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 71 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  53.97 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  49.23 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  54.69 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 65 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 70 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  50.79 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  50.79 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  57.14 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  51.67 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  49.21 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  49.21 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>