More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7889 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7889  methyltransferase small  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3777  hypothetical protein  41.85 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165446 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.09 
 
 
208 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  31.78 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.4 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  40.54 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  31.58 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  29.61 
 
 
202 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  35.11 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  28.42 
 
 
202 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  41.94 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  27.87 
 
 
202 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.03 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  31.01 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  31.01 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  28.66 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.25 
 
 
354 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  30.23 
 
 
246 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  30.23 
 
 
246 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  30.23 
 
 
246 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  29.77 
 
 
246 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  29.77 
 
 
246 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.78 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.408193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  28.79 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1896  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.4 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0721  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.01 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  27.69 
 
 
578 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2508  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.87 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.11 
 
 
343 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  30.23 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  26.38 
 
 
536 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  29.46 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.11 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  31.34 
 
 
382 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  23.64 
 
 
240 aa  53.5  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  30.91 
 
 
226 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2072  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.340756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3240  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1344  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1419  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.58 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000710273  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01259  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.23 
 
 
308 aa  52.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1325  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.67 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.63 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.82 
 
 
211 aa  52.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  32.59 
 
 
414 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  28.74 
 
 
275 aa  52.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  30.6 
 
 
382 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  41.25 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.71 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.55 
 
 
300 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2597  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.25 
 
 
330 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  30.6 
 
 
386 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  38.1 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  34 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  32.43 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.47 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.74 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2013  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.61 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673949  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  29.57 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  29.89 
 
 
185 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  30.63 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  28.78 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0866  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  36.84 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.36 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.47 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.98 
 
 
394 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1667  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.25 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  33.03 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  26.09 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1674  ribosomal L11 methyltransferase  43.08 
 
 
295 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4470  methyltransferase small  30.37 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.820054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.31 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1353  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.63 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  37.33 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  38.16 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  29.87 
 
 
558 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1427  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  38.75 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  37.97 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  31 
 
 
228 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5342  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.75 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  33.33 
 
 
486 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2739  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.48 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.74 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  37.33 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
367 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  36.84 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  31.25 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2167  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.78 
 
 
314 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.65 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  34.83 
 
 
278 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  34.83 
 
 
278 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>