23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7212 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  78.11 
 
 		 644 aa  769    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  100 
 
 		 648 aa  1236    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  31.21 
 
 		 445 aa  94.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  28.4 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.39 
 
 		 1021 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1167 aa  57.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  27.43 
 
 		 526 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  39.19 
 
 		 695 aa  48.1  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  42.86 
 
 		 1100 aa  47.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  36.14 
 
 		 875 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.69 
 
 		 634 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  43.9 
 
 		 878 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  42.86 
 
 		 814 aa  44.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  23.36 
 
 		 922 aa  44.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1194 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  32.43 
 
 		 813 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  28.28 
 
 		 586 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  28.28 
 
 		 586 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  27.66 
 
 		 891 aa  44.3  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  32.67 
 
 		 1188 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  37.62 
 
 		 1213 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0923  SMC domain protein  32.81 
 
 		 550 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.757485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.33 
 
 		 374 aa  43.9  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>