More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5601 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 746 aa  1491    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3247  oxidoreductase domain-containing protein  32.66 
 
 		 365 aa  134  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118783  normal  0.512873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 366 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 680 aa  111  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 334 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.76 
 
 		 333 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 335 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  30.15 
 
 		 363 aa  103  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 335 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.44 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  31.06 
 
 		 338 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 		 335 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.384866 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.06 
 
 		 335 aa  100  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  30.35 
 
 		 340 aa  100  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  31.06 
 
 		 335 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.16 
 
 		 329 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  31.06 
 
 		 338 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  31.06 
 
 		 338 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 337 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 356 aa  97.8  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 		 324 aa  97.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 355 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  32.56 
 
 		 328 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 336 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 		 349 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 		 330 aa  94.4  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  30.16 
 
 		 341 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  34.06 
 
 		 347 aa  94  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 		 329 aa  93.6  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 330 aa  92.8  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 		 333 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.94 
 
 		 329 aa  93.2  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 359 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  31.4 
 
 		 345 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.6 
 
 		 338 aa  92  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 321 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.15 
 
 		 340 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  29.92 
 
 		 335 aa  92.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 321 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  42.14 
 
 		 387 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  32.03 
 
 		 328 aa  92  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 330 aa  91.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 364 aa  92  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.89 
 
 		 375 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  36.68 
 
 		 347 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 		 333 aa  91.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 		 324 aa  91.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  29.76 
 
 		 341 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 		 333 aa  90.1  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 335 aa  90.5  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 335 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 335 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 324 aa  90.1  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 335 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  30.22 
 
 		 335 aa  90.5  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 343 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 358 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 321 aa  89.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  29.92 
 
 		 347 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0274  dihydroflavonol 4-reductase family protein  32.18 
 
 		 354 aa  90.1  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.522156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 355 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 319 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  29.85 
 
 		 335 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 334 aa  89  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 338 aa  89  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  31.06 
 
 		 335 aa  88.6  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 		 333 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  29.37 
 
 		 341 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 		 327 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 		 345 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.6 
 
 		 329 aa  88.2  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.23 
 
 		 329 aa  88.2  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  29.6 
 
 		 329 aa  88.2  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 342 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 346 aa  87.8  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 355 aa  87.8  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 346 aa  87.8  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 322 aa  87.8  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 358 aa  87.4  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  29.17 
 
 		 336 aa  87.4  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  28.41 
 
 		 336 aa  87.4  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  26.81 
 
 		 329 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.93 
 
 		 353 aa  86.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  27.35 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 		 356 aa  86.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 342 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 331 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  28.03 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.96 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.71 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.04 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>