More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3281 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
250 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1338  enoyl-CoA hydratase/isomerase  89.2 
 
 
250 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8048  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.38 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 
257 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.14 
 
 
255 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  40.59 
 
 
267 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
255 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.67 
 
 
255 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
257 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.66 
 
 
260 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.67 
 
 
255 aa  121  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
257 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.44 
 
 
264 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.43 
 
 
260 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.43 
 
 
260 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  40.1 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
258 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  35.24 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  37 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
258 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
259 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
259 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  39.51 
 
 
253 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 
261 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 
261 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.73 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  33.61 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.82 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  35.22 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.55 
 
 
255 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
258 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  35.1 
 
 
258 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.27 
 
 
259 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
259 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3592  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
262 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 
257 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 
257 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2806  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
274 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
255 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
258 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.15 
 
 
661 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
257 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
262 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
259 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
258 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
265 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 
257 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
259 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3343  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
263 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 
258 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
257 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 
257 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
257 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  32.85 
 
 
257 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 
257 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
257 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.05 
 
 
260 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
257 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0566  enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
263 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
255 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
259 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 
257 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
264 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
259 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.03 
 
 
260 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  33.65 
 
 
258 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 
267 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 
258 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>