190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0139 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2676  hypothetical protein  81.4 
 
 		 264 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.829729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  58.65 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  30.3 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2771  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  28.11 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  33.81 
 
 		 285 aa  85.1  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  29.04 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  30.37 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  32.81 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2484  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0152963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  27.82 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  30.23 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  35.86 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.55 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  30.74 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0052  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  28.24 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  27.8 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  28.31 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  24.82 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  30.46 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  29.21 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  29.7 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.34 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  28.1 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  27.96 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  26.89 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  45.65 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  31.95 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  28.65 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  27.78 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  31.53 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.8 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  30.37 
 
 		 1035 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.33 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.33 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.33 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.21 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  28.25 
 
 		 862 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  35.92 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  32.33 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.33 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28.18 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  24.24 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.82 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0661  extracellular solute-binding protein, family 1  25.69 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.81727e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  27.8 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.33 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.33 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  25 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  37.63 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  32.26 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  30.62 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  28.37 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  42.39 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  33.11 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  36.73 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  32.58 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  39.62 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  31.48 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0647  extracellular solute-binding protein, family 1  26.96 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000964521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.06 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  24.89 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  38.68 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.63 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  29.3 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  26.6 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  29.13 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.3 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  37.74 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  22.64 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  28.32 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  28.76 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  23.56 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.28 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  30 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  29.33 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  28.72 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26.32 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.23 
 
 		 300 aa  62  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1692  phosphate-binding protein PstS-like protein  26.98 
 
 		 319 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  38.71 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1711  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.98 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  34.34 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  24.18 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  25 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.68 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0648  extracellular solute-binding protein, family 1  24.88 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  26.64 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0660  extracellular solute-binding protein, family 1  26.18 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5102800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3493  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  31.36 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  28.37 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.4 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03232  hypothetical protein  29.2 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>