45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3565 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  100 
 
 
702 aa  1462    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  27.82 
 
 
700 aa  277  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  31.41 
 
 
1179 aa  250  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  25.54 
 
 
645 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  24.56 
 
 
618 aa  72.4  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  23.86 
 
 
638 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  23.66 
 
 
617 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  21.41 
 
 
671 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  23.57 
 
 
666 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  21.91 
 
 
671 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  23.67 
 
 
661 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  24.03 
 
 
653 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  22.97 
 
 
662 aa  57  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  22.58 
 
 
648 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23.97 
 
 
629 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  21.56 
 
 
833 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.34 
 
 
632 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  26 
 
 
638 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  22.48 
 
 
627 aa  53.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  25.5 
 
 
649 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  25.6 
 
 
470 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  25.82 
 
 
812 aa  52  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  21.49 
 
 
676 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  22.76 
 
 
578 aa  51.6  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  29.89 
 
 
891 aa  51.2  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.73 
 
 
824 aa  50.8  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  20.63 
 
 
673 aa  50.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  21.6 
 
 
605 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.08 
 
 
607 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  21.82 
 
 
626 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  24.22 
 
 
629 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  25.99 
 
 
841 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  21.09 
 
 
605 aa  47.8  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  23.08 
 
 
841 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  22.6 
 
 
604 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  22.49 
 
 
635 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 
826 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
826 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 
826 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  20.32 
 
 
616 aa  45.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  25.81 
 
 
647 aa  45.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  23.33 
 
 
821 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  20.23 
 
 
823 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  22.5 
 
 
871 aa  44.3  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
822 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>