41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2921 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
871 aa  1805    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  37.57 
 
 
197 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  35.71 
 
 
238 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  38.38 
 
 
216 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  36.2 
 
 
268 aa  134  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  35.23 
 
 
248 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  36.08 
 
 
207 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  34.32 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  33.13 
 
 
257 aa  117  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  29.28 
 
 
233 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  33.13 
 
 
280 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  28.65 
 
 
231 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  31.33 
 
 
243 aa  91.7  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  32.56 
 
 
167 aa  88.2  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  30.43 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  28.22 
 
 
240 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  22.99 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  25.84 
 
 
255 aa  70.5  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.47 
 
 
261 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.98 
 
 
447 aa  64.3  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  25.14 
 
 
424 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  58.2  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  26.14 
 
 
252 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  25 
 
 
274 aa  55.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  24.71 
 
 
1072 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  23.67 
 
 
268 aa  54.3  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  23.08 
 
 
348 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  24.74 
 
 
235 aa  52  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12504  bifunctionnal transmembrane phospholipid biosynthesis enzyme plsC: L-3-phosphoserine phosphatase + 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25 
 
 
580 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.088131  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  24.61 
 
 
249 aa  49.7  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  24.46 
 
 
227 aa  48.5  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  22.71 
 
 
275 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  26.01 
 
 
244 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.73 
 
 
221 aa  47.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  22.91 
 
 
204 aa  47.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  24.12 
 
 
226 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
234 aa  45.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  24.08 
 
 
243 aa  44.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  26.24 
 
 
153 aa  44.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  24.8 
 
 
153 aa  44.3  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>