More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0234 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
346 aa  709    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1680  alcohol dehydrogenase  71.1 
 
 
349 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1502  alcohol dehydrogenase  69.94 
 
 
349 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0812422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.79 
 
 
346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.92 
 
 
347 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.05 
 
 
347 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  66.47 
 
 
346 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.14 
 
 
346 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04785  alcohol dehydrogenase  64.81 
 
 
343 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0629663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  57.73 
 
 
338 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.34 
 
 
338 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6280  alcohol dehydrogenase  55.74 
 
 
363 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00748066  normal  0.0353239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.94 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143353  normal  0.283215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  50.72 
 
 
350 aa  355  5e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1713  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.54 
 
 
335 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1759  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
335 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3663  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.1 
 
 
348 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.45 
 
 
351 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1690  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
335 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.036718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.49 
 
 
351 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.44 
 
 
351 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2836  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.01 
 
 
353 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.205929  decreased coverage  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.96 
 
 
344 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2867  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.38 
 
 
361 aa  299  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.61 
 
 
357 aa  296  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2363  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.63 
 
 
353 aa  296  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.07 
 
 
355 aa  293  3e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0345  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 
353 aa  293  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3786  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.74 
 
 
365 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.8 
 
 
345 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1808  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.85 
 
 
357 aa  280  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3964  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 
344 aa  275  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 
361 aa  179  4e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
344 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.18 
 
 
336 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
340 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
360 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
349 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 
344 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  37.79 
 
 
342 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
342 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  34.33 
 
 
359 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.34 
 
 
344 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.34 
 
 
344 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 
343 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
336 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.32 
 
 
342 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
366 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
344 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.76 
 
 
343 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
342 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
344 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
344 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.68 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  41.84 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.92 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.92 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.92 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.92 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.5 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.92 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.92 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
338 aa  146  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  38.66 
 
 
341 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 
336 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.24 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
338 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
362 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
344 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0419  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
362 aa  144  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
348 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
341 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.17 
 
 
342 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 
342 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  41.18 
 
 
342 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  40.17 
 
 
342 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0251  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
362 aa  143  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1424  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
360 aa  143  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.350206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.01 
 
 
336 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.55 
 
 
341 aa  142  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.77 
 
 
375 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.58 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.89 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  40.34 
 
 
347 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
341 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
344 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
337 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.47 
 
 
336 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
353 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
347 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  33.09 
 
 
348 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>