184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0165 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0165  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.364368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0076  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.94 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.668019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2691  RimK domain protein ATP-grasp  46.25 
 
 		 263 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0111  RimK domain-containing protein ATP-grasp  48.81 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3095  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.8 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293473  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  27.43 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  27.66 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  27.78 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  27.55 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  30.27 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.59 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  28.03 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  28.03 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  28.03 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  28.03 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  28.03 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  26.6 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  26.74 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.11 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.22 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  27.51 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  26.98 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.98 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  26.98 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.37 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  26.98 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  26.98 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  26.98 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  26.98 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.62 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.17 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.58 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  26.98 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  32.59 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  24.85 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  26.49 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  26.92 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.01 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.71 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  25.88 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  28.85 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  28.85 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  26.47 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.63 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  27.39 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  25.97 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  26.06 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  25.32 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  26.06 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  26.06 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  25.32 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  25.45 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  27.11 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.1 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.96 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  27.92 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.15 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.17 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  29.21 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  25.45 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.15 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  26.97 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.97 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  27.11 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.15 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  24.26 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.7 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  29.61 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  26.97 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  24.66 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.97 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.22 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  26.42 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  27.27 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.61 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  26.97 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  25.49 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.27 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  24.42 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  23.67 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.94 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1115  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.24 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.62 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.84 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.84 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.84 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26.45 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.88 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32 
 
 		 447 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  24.12 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  26.97 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.36 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  24.18 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  23.08 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  26.81 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>