31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3838 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  99.3 
 
 		 143 aa  276  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  97.9 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  69.29 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0585  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.600246  normal  0.811412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1829  hypothetical protein  59.65 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470131  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  55.8 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  56.78 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  53.28 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1282  hypothetical protein  59.38 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  54.17 
 
 		 129 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  51.22 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3627  hypothetical protein  60.43 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  47.9 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  40.5 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  41.59 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  35.19 
 
 		 133 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  32.97 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  35.9 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  32.48 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  39.45 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  34.21 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  32.2 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  38.53 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  37.18 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  35.19 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  34.09 
 
 		 118 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>