More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2057 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 455 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  81.52 
 
 		 459 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  74.39 
 
 		 457 aa  702    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  99.78 
 
 		 455 aa  937    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 455 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  81.84 
 
 		 469 aa  767    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  61.54 
 
 		 455 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  62.92 
 
 		 447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  60.8 
 
 		 446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  63.44 
 
 		 454 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  61.79 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  61.75 
 
 		 464 aa  551  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  60.94 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  52.77 
 
 		 460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  51.43 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  51.61 
 
 		 470 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  49.36 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  48.12 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  45.71 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  45.71 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  48.78 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  46.65 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  45.41 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  47.32 
 
 		 455 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  47.35 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  45.18 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  44.97 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  46.53 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  45.35 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  45.86 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  46.62 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  44.98 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  42.27 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  46.78 
 
 		 459 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  46.78 
 
 		 459 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  43.3 
 
 		 463 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  43.86 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  41.83 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  40.98 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  39.82 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  37.72 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  37.72 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  37.47 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  35.49 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  31.71 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  35.86 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  36.36 
 
 		 471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  35.27 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  32.24 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  33.48 
 
 		 455 aa  223  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  33.26 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  33.49 
 
 		 460 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  33.63 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  33.71 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.27 
 
 		 439 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  33.33 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  33.18 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2888  Glutamate--ammonia ligase  31.24 
 
 		 454 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  31.83 
 
 		 486 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  30.91 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  29.82 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.99 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  30.95 
 
 		 479 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  30.26 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  29.06 
 
 		 439 aa  196  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  31.28 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  31.45 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  31.6 
 
 		 466 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  31.47 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  31.28 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  32.59 
 
 		 445 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  30.89 
 
 		 476 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  32.82 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  32.82 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  32.82 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  31.51 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  34.13 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3492  glutamate--ammonia ligase  31.8 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.38104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  30.55 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  30.77 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  31.28 
 
 		 447 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  29.77 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  31.04 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  30.72 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  32.09 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  30 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  31.44 
 
 		 440 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  32.13 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  31.93 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4399  glutamine synthetase, putative  32.31 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  31.49 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  32.73 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  32.32 
 
 		 445 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06654  glutamine synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03530)  29.54 
 
 		 478 aa  186  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  30.75 
 
 		 452 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  31.68 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  29.28 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  31.59 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20670  putative glutamine synthetase  30.85 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>