More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2788 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  916    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  61.01 
 
 
282 aa  269  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  48.66 
 
 
952 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  51.98 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  49.78 
 
 
276 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  48.62 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  47.11 
 
 
922 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  50 
 
 
611 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  46.03 
 
 
587 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  49.78 
 
 
475 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  40.16 
 
 
296 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  42.29 
 
 
267 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  42.97 
 
 
636 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  42.55 
 
 
254 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.2 
 
 
554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  44.35 
 
 
336 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  44.8 
 
 
293 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  40.08 
 
 
287 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  40.09 
 
 
416 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
621 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
625 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
593 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
620 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
715 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 
882 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 
509 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  39.83 
 
 
603 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  38.11 
 
 
287 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  37.7 
 
 
820 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  39.58 
 
 
802 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  38.08 
 
 
358 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  39.84 
 
 
929 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 
637 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  42.34 
 
 
488 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  42.56 
 
 
262 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  39.74 
 
 
781 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
637 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  40.08 
 
 
740 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  36.15 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
617 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  35.5 
 
 
538 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
618 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  39.26 
 
 
616 aa  146  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  36.05 
 
 
925 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  33.57 
 
 
453 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.14 
 
 
433 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  33.53 
 
 
768 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  33.45 
 
 
584 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  38.01 
 
 
294 aa  143  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  37.25 
 
 
892 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  36.84 
 
 
288 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  37.39 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  33.47 
 
 
346 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.55 
 
 
1911 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  36.93 
 
 
623 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  36.88 
 
 
527 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.32 
 
 
1132 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
639 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
639 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  37.61 
 
 
654 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  36.11 
 
 
269 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  37.18 
 
 
657 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  37.76 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  44.31 
 
 
555 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  34.36 
 
 
862 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  40.87 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  36.92 
 
 
877 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  34.71 
 
 
426 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  39.74 
 
 
298 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.5 
 
 
826 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  36.77 
 
 
620 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  34.51 
 
 
664 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.16 
 
 
1104 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  39.65 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  36.78 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  34.82 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.11 
 
 
390 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  34.2 
 
 
522 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  32.55 
 
 
348 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.55 
 
 
348 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  37.33 
 
 
413 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  41.71 
 
 
223 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.94 
 
 
517 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  37.02 
 
 
226 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  31.2 
 
 
586 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  37.55 
 
 
570 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  34.82 
 
 
616 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  36.54 
 
 
226 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  35.41 
 
 
225 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  34.44 
 
 
301 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  33.76 
 
 
285 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.81 
 
 
751 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  34.75 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  32.09 
 
 
276 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  36.36 
 
 
226 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  36.21 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  38.46 
 
 
224 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  32.12 
 
 
281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.39 
 
 
1196 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  37.98 
 
 
233 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>