37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1604 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  100 
 
 		 1256 aa  2557    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1341 aa  256  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  35.47 
 
 		 1004 aa  240  1e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  21.91 
 
 		 977 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  30.39 
 
 		 501 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  34.76 
 
 		 567 aa  121  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  34.54 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  27.95 
 
 		 871 aa  115  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  34.72 
 
 		 200 aa  111  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  31.67 
 
 		 425 aa  109  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  21.81 
 
 		 921 aa  108  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  30.04 
 
 		 548 aa  95.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  33.99 
 
 		 427 aa  95.1  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  31.41 
 
 		 349 aa  94.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  31.87 
 
 		 499 aa  91.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  37.31 
 
 		 152 aa  90.9  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  31.18 
 
 		 168 aa  91.3  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  27.9 
 
 		 335 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46014  predicted protein  28.09 
 
 		 588 aa  84.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  29.5 
 
 		 146 aa  82  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  29.58 
 
 		 594 aa  80.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  25.29 
 
 		 485 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  27.14 
 
 		 349 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  32.54 
 
 		 165 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16063  predicted protein  29.2 
 
 		 134 aa  72.4  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49441  predicted protein  27.24 
 
 		 1045 aa  68.6  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0740088  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  29.61 
 
 		 1416 aa  63.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49745  predicted protein  28.95 
 
 		 576 aa  63.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47913  predicted protein  30.4 
 
 		 315 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4408  helicase-associated  23.96 
 
 		 302 aa  55.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  23.43 
 
 		 1636 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43595  predicted protein  28.46 
 
 		 469 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7633  predicted protein  30.53 
 
 		 128 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.23518  hitchhiker  0.00115049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  23.03 
 
 		 1063 aa  52  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  28.69 
 
 		 1847 aa  50.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  33.33 
 
 		 951 aa  48.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 		 1613 aa  48.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>