26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0256 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1645  radical SAM domain-containing protein  96.06 
 
 
355 aa  710    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0256  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
355 aa  730    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.959358  normal  0.0374147 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0580  radical SAM domain-containing protein  94.37 
 
 
355 aa  701    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0342  radical SAM domain-containing protein  76.62 
 
 
355 aa  588  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0046  radical SAM domain-containing protein  64.51 
 
 
358 aa  488  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0057  hypothetical protein  37.64 
 
 
347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0822  Radical SAM domain protein  38.26 
 
 
334 aa  218  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1179  hypothetical protein  37.46 
 
 
346 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2174  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
358 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1373  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.05 
 
 
364 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1151  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 
313 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1428  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 
358 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2654  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.11 
 
 
366 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0658  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.25 
 
 
365 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0937  hypothetical protein  30.65 
 
 
329 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263205  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2148  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 
328 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1444  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 
328 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1266  hypothetical protein  30.97 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.541114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.04 
 
 
325 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1409  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.97 
 
 
328 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00449736  normal  0.39779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2071  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 
322 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2957  radical SAM domain-containing protein  20.78 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.378786  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0961  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0983  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 
442 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2454  Radical SAM domain protein  19.31 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  hitchhiker  0.0012286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1179  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>